倭国禁教自秀吉开始，但起初禁得并不严厉，原因就是葡萄牙商馆以中断生丝供应相威胁，秀吉不得不妥协，驱逐传教士的《伴天连追放令》无异于一纸空文。 此令颁布后，十余名传教士依然滞留在长崎并担任葡萄牙商船长崎贸易的向导，一百三十余名耶稣会士仍在九州布教，教徒数量仍在迅猛增加，而以西班牙方济各修道会为代表的其他势力也开始进入日本。 但丰臣秀吉在庆长二年一五九七年获知西班牙人企图通过传教殖民倭国后，他再也不去考虑生丝的问题，愤然在长崎将二十六名传教
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